Issus de résidus végétaux ou animaux, les engrais d’origine naturelle sont moins concentrés en minéraux que les engrais de synthèse. Cependant, les éléments nutritifs sont libérés graduellement, conformément aux besoins de la plante. Les fertilisants d’origine organique ont l’avantage d’améliorer les propriétés physiques du sol : plus de structure, bonne aération et meilleure rétention d’eau. Ils favorisent également la vie biologique et activent les micro-organismes naturels du sol.